上市药物类似物库

化合物库设计的关键步骤：
1、在公共数据库（如PubChem）中进行数据挖掘，选择超过100种结构多样的药物；
2、使用Tanimoto（Ti）相似性评分在库存数据库（160万种化合物）中搜索与已批准药物相似的化合物：
（1）圆形指纹：ECFP4（RDkit实现）；
（2）Mol2Vec表示；
（3）选择与已批准药物Ti相似性大于0.6的化合物。
3、结构多样性筛选（层次聚类；Min-Max算法；Dice相似性/ECFP4）。
该数据库包含与多种治疗领域相关的小分子精选，具体如下：
1、抗病毒药物：111种化合物
2、镇痛药（止痛药）：90种化合物
3、抗过敏药物：89种化合物
4、杜氏肌营养不良症治疗药物：75种化合物
5、免疫抑制剂：68种化合物
6、帕金森病治疗药物：46种化合物
7、抗生素：45种化合物
8、糖尿病管理药物：30种化合物
该化合物库收录了一系列已注册药品的类似物，包括：
1、氯环利嗪（78种化合物）
2、达卡他韦（77种化合物）
3、阿塔鲁伦（75种化合物）
4、伊斯特拉地非林（43种化合物）
5、硝唑尼特（38种化合物）
6、那格列奈（27种化合物）
7、氯哌斯汀（20种化合物）
8、磺胺甲噻唑（19种化合物）

• 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管；
• 干粉蓝冰运输，DMSO溶液干冰运输；
• 排布：96孔板：1st & 12th 空白对照，384孔板：1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。