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基于片段的药物设计(Fragment-baseddrugdesign,FBDD),其理论基础是挑选有利的片段组合或延伸得到新药物分子,获得高活性的候选药物。与HTS相比,数千种片段分子即可组合出数百万种药物结构,更容易收集和管理,此外,片段的分子量更小,溶解度相对更高且更易进行结构优化,成药潜力更高。
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基于片段的药物设计
片段化合物数据库介绍
FBDD方法成功运用
白相互作用等复杂靶点,其结合口袋较为平坦,化合物难以结合,HTS在这一领域几乎失效, FBDD则可先识别具有弱结合作用的小片段,进一步优化结构,获得潜在成药化合物。
目前通过这种方式已发现多个小分子药物,其中有30多个进入临床阶段,以及两个上市药物:Vemurafenib & Venetoclax。
鉴于FBDD方法的成功运用,其在药物研发领域将会更受药物研发专家青睐。
AnyMole在片段化合物上的优势
一个好的片段库是FBDD方法成功的前提条件。对于片段库而言,一般需要考虑Ro3原则(mw<300,HBA<3,HBD<3,Rotable bond<3,
cLogP<3)、3D结构多样性、溶解性等。 此外,有些研究人员会对含特定基团的片段库感兴趣,比如含氟片段、含溴片段等。
结合实验特点,选择合适的片段库可以缩小筛选范围,更加合理的设计药物,为后续药物开发减小难度。 AnyMole收集了46万余种片段化合物数据,为研究人员提供更多的选择。
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