抗菌筛选化合物库

抗菌聚焦化合物库
通过对内部数据库进行二维指纹图谱相似性搜索（Tanimoto相似性指数 > 0.80，每个参考化合物选取 < 10 个类似物以确保多样性），我们筛选出约15,500个具有潜在抗菌活性的类药筛选化合物。
我们建立了一个参考化合物集，这些化合物对不同革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌具有已报道的抗菌活性（如下所示）。活性数据阈值设定为 < 10 μM，数据来源于Binding和ChEMBL数据库。最终，我们挑选出约8,900个对细菌具有有效作用的筛选化合物，以及超过6,900个对以下与细菌相关蛋白靶点具有已知活性的小分子类似物。

抗菌靶向化合物库
由于冠状病毒感染的疫情持续蔓延，呼吸道疾病病原体的研究以及针对这些病原体开发有效药物的工作正受到越来越多的关注。
脑膜炎奈瑟菌和肺炎链球菌是侵袭性细菌感染的病原体，可引发多种疾病，如脑膜炎和败血症。肺炎克雷伯菌既是肺炎的病原体，也是医院获得性人类感染的病原体，其特点是具有高毒力和对抗生素（尤其是碳青霉烯类抗生素）的高度耐药性。这些病原体在全球范围内广泛传播，在病情严重时可导致致命后果。
为应对这些紧迫问题，我们的化学信息学团队设计了这个包含约2,700种结构多样的筛选化合物的筛选集，这些化合物具有潜在的生物活性。这些分子是通过虚拟分子筛选从与上述微生物存活、毒力及耐药性密切相关的、最重要的肺炎致病菌药物靶点中挑选出来的，包括：
• N-乙酰神经氨酸合成酶（NeuB）
• 金属β-内酰胺酶（MBL）
• 脑膜炎奈瑟菌唾液酸酶NanB（NanB）

N-乙酰神经氨酸合酶（NeuB）
N-乙酰神经氨酸合酶（NeuB）是一种细菌唾液酸合酶，对脑侵袭性细菌（如脑膜炎奈瑟菌）至关重要，使其能够合成N-乙酰神经氨酸（NeuNAc），从而逃避免疫系统的攻击。这使得NeuB成为抗菌药物研发中极具潜力的药物靶点。
主要特点：
• 方法：高通量虚拟筛选（基于药效团假设）
• 使用的X射线数据：6PPY
• 应用的筛选条件：QikProp性质与描述符
• 筛选出的化合物数量：586个

金属β-内酰胺酶（MBL）
全球范围内抗生素耐药性的上升，尤其是革兰阴性菌对β-内酰胺类抗生素的耐药性，主要通过β-内酰胺酶介导，这对目前的抗菌治疗构成了严重威胁。碳青霉烯类抗生素能够规避大多数β-内酰胺酶的作用，但它们会被金属β-内酰胺酶（MBLs）以及少数活性位点为丝氨酸的β-内酰胺酶（SBLs）水解，从而导致如肺炎克雷伯菌等肠杆菌科细菌对其产生耐药性。尽管在β-内酰胺酶抑制剂研发方面已取得显著进展，但开发有效的金属β-内酰胺酶抑制剂仍然是一项挑战。
关键特征：
• 方法：高通量虚拟筛选（基于药效团假说）
• 使用的X射线数据：6V1M
• 使用的筛选条件：QikProp性质与描述符
• 筛选出的化合物数量：1673个

脑膜炎奈瑟菌唾液酸酶NanB（NanB）
神经氨酸酶（唾液酸酶）在细菌致病性和流感病毒毒力中具有重要作用。它们是肺炎链球菌获取营养的关键酶，能够分解宿主细胞表面的糖类，从而导致呼吸道损伤。上述特性使NanB成为抑制细菌感染的潜在药物靶点。
主要特点：
• 方法：高通量虚拟筛选（基于药效团假设）
• 使用的X射线数据：4XHB
• 使用的筛选条件：QikProp性质与描述符
• 筛选出的化合物数量：855种

• 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管；
• 干粉蓝冰运输，DMSO溶液干冰运输；
• 排布：96孔板：1st & 12th 空白对照，384孔板：1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。