阿尔茨海默病(AD)是最难治疗的中枢神经系统疾病之一。尽管在过去几十年里进行了大量的研究,但尚未开发出有效的药物来对抗这种可怕的疾病。然而,关于β-分泌酶抑制剂的最新数据在这个领域显示出了希望的结果。在疾病的早期阶段,BACE抑制似乎是对抗AD进展的强有力工具。这些数据为设计一个具有最多样化的化学类型和良好中枢神经系统特性的高质量BACE靶向库提供了基础。BACE库包含7171个化合物。
https://enamine.net/compound-libraries/targeted-libraries/bace-library

库设计
经仔细整合与BACE相关的活动数据库(通过检索ChEMBL及文献数据获得),共发现7,465种具有充分活性报道的化合物。同时分析了所有可用的PDB结构,并选用23个最具代表性的PDB复合物进行分子对接计算。下文将介绍用于搜索BACE靶点潜在调节因子的进一步算法。
步骤1 :通过使用PDB、PDBe和Pfam数据库,筛选了所有可用的蛋白质结构。
同时,基于文献数据和ChEMBL数据库,选取了所有活性化合物。
步骤2 :最终选出23个最具代表性的结构用于分子对接(PDB代码:2b8v、2ohr、2viz、2wjo、2zdz、3exo、3fkt、3hw1、3in3、3l38、3l5b、3l5f、3rsx、3udy、3uqw、3vf3、4acu、4i10、4l7h、4xkx、5hdv、5kqf、5uyu)。
步骤3 :随后,利用获得的BACE受体结构和Enamine化学数据库,进行了柔性分子对接筛选。
步骤4 :最终,针对BACE蛋白靶点,从对接库中筛选出7,171个化合物。
