Caspase靶向化合物库

Caspase Targeted Library

Caspases是一类半胱氨酸蛋白酶，它们在细胞凋亡（程序性细胞死亡）、坏死和炎症中发挥着重要作用。细胞凋亡对于通过清除老化、不必要或不健康的细胞来维持身体健康状态至关重要。为了寻找潜在的caspase抑制剂和与凋亡相关的化合物，使用基于对接的虚拟筛选方法设计了其Caspase靶向库。Caspase靶向库包含2800个化合物。

陶术生物的所有产品和服务仅用于科学研究，我们不为任何个人用途提供产品和服务。

产品编号： LF6400

规格
10 μL x 10 mM (in DMSO)
20 μL x 10 mM (in DMSO)
30 μL x 10 mM (in DMSO)
50 μL x 10 mM (in DMSO)
100 μL x 10 mM (in DMSO)
250 μL x 10 mM (in DMSO)

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技术资料

产品描述

产品描述:
背景信息
在急性（心肌梗死、中风、败血症）和慢性（神经退行性疾病，特别是阿尔茨海默病、帕金森病和亨廷顿病）状态下，细胞损伤部位常观察到细胞凋亡水平和半胱天冬酶活性升高。炎症性半胱天冬酶在调节炎症及炎症性疾病（如银屑病、关节炎、败血症等）中起关键作用。炎症与细胞死亡也是许多代谢性疾病（如肥胖症、糖尿病和肝病）发病机制的核心因素。因此，半胱天冬酶成为治疗神经退行性疾病、代谢紊乱、癌症及炎症的重要靶点。

所有半胱天冬酶均具有若干共同特征：包括由活性位点Cys285（保守QACXG五肽序列组成部分）、His237及177位残基骨架羰基（按半胱天冬酶-1编号）构成的催化三联体；其最显著特性是能特异性切割天冬氨酸残基后的底物，这一特性在哺乳动物蛋白酶中独一无二。

图1. 细胞死亡途径中的Caspases蛋白酶。

图2. Caspase介导的炎症反应。

首先筛选出一组与对应蛋白质共结晶的强效 caspase 抑制剂作为参考集，并基于配体的晶体学构象建立查询特征。随后使用 TopomerSearch（SYBYL-X）工具对预选的筛选化合物库进行扫描，最终通过内部 MedChem 和 PAINS 过滤器排除具有非预期结构的化合物。
研究共识别出 2,800 余个潜在 caspase 调节剂，主要聚焦于细胞凋亡信号通路中的关键靶点（对应 PDB 条目标注于括号内）：
CASP1 (RCSB PDB ID: 1RWX)

CASP2 (RCSB PDB ID: 1PYO)

CASP3 (RCSB PDB IDs: 2CNO and 2CNL)

CASP6 (RCSB PDB: 3OD5)
CASP7 (RCSB PDB: 3EDR and 2QL9)

CASP8 (RCSB PDB: 1QTN and 3KJN)

CASP9 (RCSB PDB: 1NW9)

Paracaspase (RCSB PDB: 3V4O)
图3. 人源caspase-1与4-氧代-3-{6-[4-(喹喔啉-2-基氧代)-苯甲酰氨基]-2-噻吩-2-基-己酰氨基}-丁酸的复合物结构。
包装和储存:
- 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管；
- 干粉蓝冰运输，DMSO溶液干冰运输；
- 排布：96孔板：1st & 12th 空白对照，384孔板：1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。