尽管过去几十年在医学领域取得了显著成就,开发有效的新型抗病毒药物和疫苗对现代药物研发而言,依然是一项充满挑战的任务。病毒与宿主细胞共享大部分代谢过程,这使得寻找选择性抗病毒药物变得困难。然而,一些酶仅存在于病毒中,这些酶是抗病毒药物潜在且最具吸引力的作用靶点。
例如,在涉及核酸(如DNA和RNA聚合酶)的过程中,有几种关键酶发挥着作用。此外,逆转录酶作为抗病毒靶点也具有巨大潜力。先前获批的抗丙肝药物索非布韦的成功,证明了小分子药物的效力以及病毒RNA聚合酶作为药物靶点的重要作用。吉利德公司推出的一系列具有核苷类似物结构的新型候选药物,在治疗近期出现的新型冠状病毒、埃博拉病毒和呼吸道合胞病毒等严重病毒感染方面,已显示出令人鼓舞的效果。
因此专为发现新的核苷样抗病毒药物而设计了抗病毒库,包含3200种独特的小分子核苷模拟物。
https://enamine.net/compound-libraries/targeted-libraries/antiviral-library

库设计
通过分析已知抑制剂的化学结构,我们发现其中绝大多数是AVR-3200侧链类似物,这些化合物在活性位点不易被病毒酶与天然核苷区分开来。
因此,综合考虑天然核苷及已报道的核苷类抗病毒药物的药效团特征与拓扑结构,我们从化合物筛选库中精心挑选了一系列核苷类似物,构建成本抗病毒化合物库。该文库中的化合物既含有类天然的结构片段,也包含了作为核苷生物电子等排体的多种杂环结构。此外,我们特别侧重筛选那些具有多个氢键供体的化合物,这类分子有潜力与蛋白的核苷结合位点形成类似天然核苷的相互作用模式。
以下是本抗病毒化合物库中部分代表性化合物的示例:
该库分子构成概述
所选化合物具有理想的药物/先导化合物类物理化学及结构特性,这些特性是核苷及其模拟物的典型特征:分子量150至400,计算LogP值-2至4;拓扑极性表面积小于150,可旋转键小于7;氢键供体数1至5,氢键受体数1至7。
该库被认为是开展广泛抗病毒药物发现项目的便捷起点。
