离子通道是生物组织中分布最广泛的蛋白之一,其相关基因家族庞大,具有细胞特异性表达模式,在多种细胞类型中发挥关键作用。作为药物化学领域最具挑战性的研究方向之一,此类治疗靶点的开发对研制新型高效医疗手段具有至关重要的意义。
https://enamine.net/compound-libraries/targeted-libraries/ion-channel-library

库设计
在理性库设计方面,我们采用了多管齐下的方法,旨在获得一组高质量的、专注于离子通道靶点的分子。其中一项主要贡献源于Enamine公司的"先导导向合成计划",该计划旨在提高化合物的新颖性和结构多样性。该项目已产出36,800个具有先导化合物特性的分子,这些分子基于新颖骨架构建,其特征是含有已被识别为潜在离子通道阻滞剂的饱和环。
我们基于药效团配体的偏好性分析,对包含超过1,000个高活性配体(活性≤10 nM)的参考集进行了研究,从而确定了三个在已报道的配体中频繁出现的主要药效团基序。利用优化后的模型,我们检索了Enamine筛选化合物库的先导化合物部分和REAL数据库的先导化合物部分。所推导出的药效团的一个共同特征是含有叔/仲氨基。
在分析已知离子通道阻滞剂的优势结构,并对一些新近发现的离子通道及TRPV1调节剂进行结构修饰后,我们向文库中补充了更多化合物。最终,通用药物化学评估完善了文库的整体轮廓,确保了其具备有利的理化参数和满足要求的溶解性。
分子举例
分子特征
