离子通道靶向化合物库（基于药效团）

Ion Channel Targeted Library (Pharmacophore Based)

人类基因组测序已经鉴定出超过400种可能的离子通道，但其中只有一小部分被克隆并进行了功能测试。离子通道广泛分布于组织中，并且其开放和关闭带来了众多生理学效应，使得离子通道靶向药物发现变得非常引人注目。尽管已经有一些重要的药物在临床上使用，但许多现有药物的选择性较差，并且具有明显的毒性或亚组的疗效。
通过一种基于受体的方法，从我们的专有HTS化合物库中精心挑选了超过5,500个潜在的离子通道阻断剂，设计了一个原创的离子通道靶向化合物库。

陶术生物的所有产品和服务仅用于科学研究，我们不为任何个人用途提供产品和服务。

产品编号： LF9800

规格
10 μL x 10 mM (in DMSO)
20 μL x 10 mM (in DMSO)
30 μL x 10 mM (in DMSO)
50 μL x 10 mM (in DMSO)
100 μL x 10 mM (in DMSO)
250 μL x 10 mM (in DMSO)

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技术资料

产品描述

产品描述:
本研究采用蛋白质数据库中十种人类离子通道靶点（与小分子离子通道调节剂形成的复合物）的X射线数据：
• 红藻氨酸1型离子型谷氨酸受体（GRIK1）
• 膜联蛋白V
• K钾离子通道亚家族K成员10
• 小电导钙激活钾通道蛋白2（SK2）
• 甘氨酸受体α-3亚基
• NMDA 2A型离子型谷氨酸受体（GRIN2A）
• 谷氨酸受体2（GluR2）
• 离子型谷氨酸受体GluR5
• 兴奋性氨基酸转运蛋白1（EAAT1）
• 囊性纤维化跨膜传导调节因子（CFTR）

针对每个复合物，我们构建了基于受体的药效团模型，其中包含描述结合模式的多种"特征"：氢键供体、氢键受体、芳香环、疏水基团、正电荷或负电荷（图1）。每个模型均设有"排除体积"，用于模拟配体周围结合位点的原子空间分布，从而在虚拟筛选中阻止化合物定位于这些空间点。
随后，使用预生成构象（每个化合物最多50个构象）将内部数据库对每个药效团模型进行筛选（图2-3）。初步获得的潜在离子通道调节剂经过五规则、PAINS过滤及内部药物化学过滤器处理，以去除含有"不良"基团及反应性基团的分子。
最终筛选集中选定了靶向离子通道的类药性化合物，这些化合物在对应药效团模型中显示出最佳匹配度。相关靶点信息及药效团"匹配度"评分已一并提供。

图1. 基于甘氨酸受体α-3亚基与AM-3607结合的药效团模型。模拟受体原子的排除体积以蓝绿色球体表示。

图2. 化合物与SK2离子通道药效团模型匹配的示例。模拟受体原子的排除体积以蓝绿色球体表示。

图3. 化合物中匹配Annexin V药效团模型的示例。模拟受体原子的排除体积以蓝绿色球体表示。
包装和储存:
- 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管；
- 干粉蓝冰运输，DMSO溶液干冰运输；
- 排布：96孔板：1st & 12th 空白对照，384孔板：1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。