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连接酶靶向化合物库

Ligase Focused Screening Library

连接酶是能够催化两个大分子之间建立新的化学键的酶类,通常伴随着其中一个庞大分子上小分子化学基的水解,或者简单地将两个化合物连接在一起。它们被归类为EC 6酶的一级类别,并进一步分为六个亚类,即建立碳-氧键、碳-硫键、碳-氮键、碳-碳键、磷酸酯键和氮-金属键的连接酶。这些蛋白质参与各种细胞途径,包括但不限于蛋白质转运、亚细胞定位、先天免疫应答、病毒感染、DNA损伤应答和细胞凋亡。但更常见的是连接酶系统在肿瘤发生和癌症发展中发挥重要作用。
我们设计了一个包含超过4,100个类药筛选化合物的库,这些化合物是已知连接酶抑制剂的小分子类似物,并具有实验确定的活性。因此,该库的参数使其成为药物发现项目中新结构的优秀来源。

  • 陶术生物的所有产品和服务仅用于科学研究,我们不为任何个人用途提供产品和服务。
LF5400
产品编号: LF5400
  • 规格
  • 10 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 20 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 30 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 50 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 100 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 250 μL x 10 mM (in DMSO)
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技术资料

产品描述
  • 产品描述:

    化合物筛选
    首先,从CHEMBL数据库获取了包含23,174个具有已知连接酶抑制活性的参考化合物集合。通过筛选保留仅对连接酶靶标具有中高活性的化合物,进一步过滤后得到包含10,000个独特连接酶调节剂的12,000条活性数据。
    随后,以参考集合为基础对内部数据库进行二维指纹相似性搜索(塔尼莫托系数>0.85,每个参考化合物最多匹配50个类似物)。此外,最终筛选库中移除了含高反应性基团的分子,使其成为针对连接酶药物研发项目的优质新化学结构来源。
    本次搜索涵盖以下连接酶靶点(图1):

    • Proline-tRNA ligase
    • Lysine-tRNA ligase
    • Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N
    • Tumour suppressor p53/oncoprotein Mdm2
    • E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33
    • E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1
    • Acetyl-CoA carboxylase
    • Lysine--tRNA ligase
    • Inhibitor of apoptosis protein 3
    • Acetyl-CoA carboxylase 2
    • MDM2-MDMX
    • p53-binding protein Mdm-2
    • Pantothenate synthetase
    • Acyl-CoA synthase
    • Prolyl-tRNA synthetase
    • Methionyl-tRNA synthetase
    • Acetyl-CoA carboxylase 2
    • Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha chain
    • SUMO E1/E2
    • DNA ligase 1
    • Proline--tRNA ligase
    • Transcription intermediary factor 1-alpha
    • Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic
    • UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D-alanine ligase
    • E3 ubiquitin-protein ligase
    • E3 ubiquitin-protein ligase ZFP91
    • Lysyl-tRNA synthetase
    • E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4
    • E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1 or NEDD4
    • NH(3)-dependent NAD(+) synthetase
    • UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamyl-lysine-D-alanyl-D-alanine ligase
     Ligase Focused Screening Library
    图1. 库中按通用靶点类别划分的化合物分布
  • 包装和储存:
    • 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管;
    • 干粉蓝冰运输,DMSO溶液干冰运输;
    • 排布:96孔板:1st & 12th 空白对照,384孔板:1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。
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