脂质代谢化合物库

ChemDiv虚拟筛选方法
Swiss-Prot蛋白靶点和PDB X-射线结构搜索
训练集 - ChEMBL 25，PubMed，当前专利文献（CAS，Integrity）
机器学习数据整理：
a）KNIME/RDKit，kNN分类器，位向量余弦空间距离，FCFP12（10,240位）指纹
b）混合2D QSAR/指纹模型 - 核化学分类/回归（kcc）
3D形状相似性虚拟筛选：
基于结构的（配体，片段，共价片段）对接/虚拟筛选：
a）多重受体构象（MRC）4D对接；
b）配体偏向的集合受体对接（LigBEnD）；
REOS，MedChem和PAINS过滤器 - 去除反应性，有毒，混杂和其他不良结构基团
多样性挑选（Tanimoto）：RDKit实现的MaxMin算法

• 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管；
• 干粉蓝冰运输，DMSO溶液干冰运输；
• 排布：96孔板：1st & 12th 空白对照，384孔板：1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。