天然产物相似物化合物库

Natural Product-like Compound Library by Similarity Search

自古以来，天然产物便被用于疾病治疗与康复。它们显然为现代药物化学、药物发现与开发提供了重要启示。过去几十年间，美国食品药品监督管理局批准的药物中约40%是天然产物、其衍生物或与天然产物相关的合成模拟物。如今，基于天然化合物的新药已成功应用于肿瘤、病毒性及细菌性疾病、神经系统疾病等的治疗。
基于二维指纹相似性过滤比对天然化合物支架筛选出约11,400个结构多样化的化合物。

陶术生物的所有产品和服务仅用于科学研究，我们不为任何个人用途提供产品和服务。

产品编号： LF1019

规格
10 μL x 10 mM (in DMSO)
20 μL x 10 mM (in DMSO)
30 μL x 10 mM (in DMSO)
50 μL x 10 mM (in DMSO)
100 μL x 10 mM (in DMSO)
250 μL x 10 mM (in DMSO)

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技术资料

产品描述

产品描述:
背景
高达20%的天然产物处于类药五原则（Ro5）之外的化学空间，通常会在先导化合物优化阶段被淘汰。然而，许多此类天然产物类药物仍显示出治疗危重疾病的潜力（例如作为HIV蛋白酶抑制剂、抗癌药物和心脏兴奋剂等应用）。天然产物具有极高的结构多样性。与典型的合成类药小分子相比，天然产物通常具有更多sp3杂化的桥头原子、更多手性中心、更高的氧含量但更低的氮含量、更高的分子量、更多的氢键供受体、更低的计算脂水分配系数（cLogP）值、更高的分子刚性，且更倾向于脂环结构而非芳环结构。
天然化合物中显著的分子骨架多样性与类药特性，为在药物发现和先导化合物优化所需的优势化学空间内，构建新型天然产物衍生化合物库提供了设计基础（图1）。

图1. 2019年9月30日前获得批准的小分子药物（自1981年1月1日起），n=1394（图片来源：《天然产物杂志》2020年第83卷第3期770-803页）。

化合物库设计
此筛选库的设计基于二维指纹相似性过滤比对天然化合物支架，参考集来自Specnet、TARGETMOL、SELECKCHEM、ICC、AnalytiCon Discovery、TimTec及COCONUT等商业数据库。通过应用塔尼莫特相似度85%的阈值，最终从内部数据库中筛选出约11,400个结构多样化的化合物。

图2. 2021年FDA批准药物按化学结构分类示意图。本化合物库中的部分示例与今年获批的两种药物具有相似性。
包装和储存:
- 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管；
- 干粉蓝冰运输，DMSO溶液干冰运输；
- 排布：96孔板：1st & 12th 空白对照，384孔板：1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。