天然产物的筛选促成了数量可观的药物发现。在小型化合物库中,富集那些具有自然界已验证的结构基元的化合物,有助于获得更优的分子特性并提升生物响应。在药物研发领域,类天然产物片段应占有一席之地,它们是探索诱人化学空间、极具潜力的研发起点。
天然产物样化合物库包含4160个化合物。
https://enamine.net/compound-libraries/fragment-libraries/natural-product-like-fragments

主要特点
• 采用骨架树(Scaffold Tree)方法处理包含超过20万种化合物的通用天然产物数据库(UNPD),提取初始骨架集。
• 应用药物化学结构过滤和精修方法,去除常见化学结构、PAINS(频繁命中化合物)及高丰度核心骨架,得到包含550个结构参考的骨架集。
• 通过子结构和相似性搜索,提取具有类天然核心骨架和片段的化合物。进行骨架频率分析,以最终确定和优化片段库。
分子举例
