蛋白相互作用片段化合物库

PPI Fragment Library From Enamine

蛋白质-蛋白质相互作用调控着生命周期的绝大多数方面，因而成为当代药物开发中最具吸引力与前景的靶点。这一领域尚未得到充分探索，且参与此类相互作用的蛋白质尚无普遍规律可循。此类复杂的生物系统若采用传统的高通量筛选方法与算法，难以在成本可控的条件下有效处理。然而，基于片段的方法在寻找新型PPI抑制剂方面已展现出丰硕成果。我们凭借对常见PPI抑制剂的系统性认识，并依据优势结构基元进行筛选，通过专门设计构建了全新的PPI片段库。
PPI（蛋白质-蛋白质相互作用）片段库包含3600个化合物。
https://enamine.net/compound-libraries/fragment-libraries/ppi-fragments

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产品编号： EN5200

规格
1 mg
100 μL x 10 mM (in DMSO)
250 μL x 10 mM (in DMSO)

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技术资料

产品描述

产品描述:
关键特性
近期关于PPI片段的研究表明，由于作用界面较大，相比常规片段通常需要更高分子量的化合物。因此，我们运用“四原则”筛选规则初步提取PPI片段子集，这类片段通常具有更大分子量和更高亲脂性。此外，采用结合经验证描述符的机器学习方法（决策树）进一步优化了片段库。
“热点”概念在设计中得到应用，即聚焦参与PPI的关键氨基酸残基。大量所选片段含有与这些热点相对应的基团/结构单元。同时，库中富集了具有类α螺旋结构的分子，以模拟蛋白质基序。由于氢键在PPI中常起关键作用，我们优先选择至少含一个氢键供体（>70%）和一个氢键受体（100%）的分子。

分子举例

分子特性
包装和储存:
- 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管；
- 干粉蓝冰运输，DMSO溶液干冰运输；
- 排布：96孔板：1st & 12th 空白对照，384孔板：1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。