在多种细胞过程中起关键作用,蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)是底物结合位点阻断效应的主要原因。大量候选药物因直接拮抗剂的意外作用而从临床试验中撤出,这突显了开发强效蛋白质-蛋白质相互作用抑制剂的重要性。我们精心筛选了40,640种靶向PPIs的多样化化合物。
https://enamine.net/compound-libraries/targeted-libraries/ppi-library

库设计
通过对大量蛋白质-蛋白质相互作用的现有结构数据进行系统性分析,我们开发了专门的文库设计方法。我们分析了超过20种不同的蛋白质-蛋白质复合物,以突出该领域中多数高效抑制剂的具体特征。在文库设计中,我们采用了多种特异性识别模式,如α-螺旋、β-折叠、PDZ结构域、PBD结构域以及溴结构域。基于配体和结构的计算机筛选结果,我们精选出了一系列化合物,其具备以下特点:
• 特异性识别模式,包括热点区域分析、关键氨基酸、二级/三级结构、α-螺旋、“热点环”及特定蛋白质结构域亲和力。
• 类先导化合物特性及富含sp3碳的核心结构基元。这些化合物已通过包括PAINS在内的所有相关药物化学过滤器筛选。
• 最新化学技术与新颖构建模块。通过REAL数据库技术,可对已鉴定的苗头化合物快速进行类似物合成与后续开发。
支架填充PPI库的示例
分子特征
