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骨架多样性精选库

骨架多样性精选库包含 7160个独特分子,涵盖了 6941个结构相似性聚类簇和 3563个Bemis-Murcko框架。该库旨在为药物发现、化学信息学研究和分子库构建提供广泛且多样化的化学空间覆盖。通过精心设计和筛选,让整个库包含多种独特骨架结构的同时保持较小的规模,减少初期筛选的时间与成本,从而提高药物开发的效率和成功率。

  • 陶术生物的所有产品和服务仅用于科学研究,我们不为任何个人用途提供产品和服务。
CB3000
产品编号: CB3000
  • 规格
  • 10 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 20 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 30 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 50 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 100 μL x 10 mM (in DMSO)
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技术资料

产品描述
  • 产品描述:
    • 7160个分子:这些分子经过严格筛选,确保高质量和高多样性。
    • 6941个结构相似性聚类簇:基于Tanimoto相似性指数进行聚类,每个簇内的分子具有高度的结构相似性,而不同簇之间的分子则具有显著的差异。
    • 3563个Bemis-Murcko框架:涵盖了广泛的分子骨架类型,从简单的链状结构到复杂的多环系统,确保对化学空间的全面覆盖,为不同靶点提供更多的结构可能性。
    • 符合 Lipinski 五规则和 Veber 标准,具有较高的成药潜力;
    • 剔除PAINS和不稳定的分子结构,减少筛选假阳性率;
    • NMR/LCMS检测,确保产品结构正确,纯度高,减少假阳性。
  • 优势介绍:

    骨架多样性精选库符合Lipinski规则,具备良好的成药潜力:

    • 分子量范围300-500,剔除分子量过小的简单分子,减少非特异阳性分子出现的概率,剔除分子量过大的复杂分子,分子更易透过细胞膜,并能降低后续结构改造难度。
    • 氢键受体数范围1-9,控制氢键受体的数量有助于提高化合物的膜通透性和溶解性,从而改善口服吸收。
    • 氢键供体数范围0-5,提高化合物的膜通透性,从而改善口服吸收。
     Scaffold Diversity Curated Library  Scaffold Diversity Curated Library  Scaffold Diversity Curated Library

    良好的溶解性质:

    • cLogP范围-4.5-6,主要集中分布于0-4之间。较高的LogP值具有更好的脂溶性,更易透过细胞膜,较低的LogP值具有更好的水溶性,使药物分子更易被吸收。本库的cLogP范围选取适中,在亲脂性和水溶性之间体现较好的平衡。
    • LogSw范围-8-1,主要集中分布于-4-0之间。LogSw在-4-0之间的化合物水溶性更好。
     Scaffold Diversity Curated Library  Scaffold Diversity Curated Library

    符合Veber规则,具有良好的口服生物利用度特性:

    • 可旋转键数量范围0-10,主要集中在3-6之间,保持适度的分子刚性,提高结合特异性和生物活性,
    • 拓扑极性表面积范围6-150,主要集中在40-120之间,控制化合物的极性特征,减少与水分子的过度相互作用,提高膜通透性。
     Scaffold Diversity Curated Library  Scaffold Diversity Curated Library

    优异的结构多样性,两种多样性挑选方式,提升化合物库结构多样性:

    • 相似性聚类分析:基于MACCS分子指纹,通过70%的Tanimoto相似性阈值聚类分析,挑选结构差异性明显的化合物。本库的聚类簇(Cluster)中有6797个簇仅包含一个化合物,不同化合物之间具有较显著的差异性。
    • Bemis Murcko框架分析:将所有分子分解为其核心骨架和侧链部分,突出其关键结构特征,为每个分子生成Bemis Murcko框架。再对同框架的分子进行多样性挑选,其中2473个Bemis Murcko框架仅挑选1个对应分子,511个Bemis Murcko框架仅挑选2个对应分子。
     Scaffold Diversity Curated Library  Scaffold Diversity Curated Library
  • 包装和储存:
    • 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管;
    • 干粉蓝冰运输,DMSO溶液干冰运输;
    • 排布:96孔板:1st & 12th 空白对照,384孔板:1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。
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