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SH2域靶向化合物库

SH2 Domain Focused Library

Src homology 2(SH2)结构域是由100个氨基酸组成的模块单元,能够识别靶向受体酪氨酸激酶及其他信号蛋白上的酪氨酸磷酸化肽序列并与之结合,从而介导细胞内蛋白质-蛋白质相互作用。研究表明,SH2结构域在各种激酶介导的细胞内信号转导通路中发挥关键作用。针对这一特性,本团队通过基于受体的研究方法——利用SH2结构域-抑制剂复合物的X射线数据构建药效团模型,开发了包含2200个类药筛选化合物的SH2结构域聚焦库,该化合物库中的分子均具有预测的SH2结构域亲和力。

  • 陶术生物的所有产品和服务仅用于科学研究,我们不为任何个人用途提供产品和服务。
LF1017
产品编号: LF1017
  • 规格
  • 10 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 20 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 30 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 50 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 100 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 250 μL x 10 mM (in DMSO)
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技术资料

产品描述
  • 产品描述:

    背景信息
    通常来说,人类有超过110种蛋白质包含SH2结构域,包括激酶、转录因子和衔接蛋白。这些蛋白质广泛存在于多种功能环境中,尤其常见于磷脂酶Cγ(PLCγ)的催化结构域、非受体型蛋白酪氨酸激酶、小型衔接分子(如Crk和Nck),以及结构蛋白(如胞衬蛋白和张力蛋白)中。这类蛋白质中有许多在疾病(包括癌症、糖尿病、免疫缺陷等)状态下会被过度激活,且其功能高度依赖SH2结构域。
    因此,通过破坏蛋白质中SH2结构域的功能来抑制其活性,被视为开发新型疗法的有效途径。尽管靶向SH2结构域存在挑战,但已有研究在合成抑制剂方面取得进展,表明这种药物研发策略具有广阔前景。

    化合物筛选
    首先,我们从蛋白质数据库获取了所有可用的SH2结构域与小分子抑制剂结合的X射线结构(共157个),通过人工筛选将范围缩小至63个结构。经过多样性分析并通过分子聚类剔除相似结构后,最终生成14个三维药效团模型,并针对内部数据库进行筛选。
    应用这14个药效团假说进行虚拟筛选后,共发现5,000余个虚拟筛选命中化合物,这些化合物对应4个药效团模型(图1)。通过对复合物进行人工审查及药物化学筛选后,我们选取了2,200个评分最高且结构多样性的潜在SH2抑制剂纳入聚焦库。
    该SH2结构域筛选化合物库已排除PAINS(泛抑制剂)、毒性及反应性化合物,但由于许多SH2抑制剂为多肽类物质,因此未采用类药五原则(Ro5)作为筛选标准。

     SH2 Domain Focused Library
    A
     SH2 Domain Focused Library
    B
     SH2 Domain Focused Library
    C
     SH2 Domain Focused Library
    D
    图1. SH2药效团模型及其在SH2靶向库中的对应匹配物。这些模型基于SH2结构域与不同配体的复合物(X射线数据)生成。A:1O4H B:1O4I C:1IJR D:1O4A
  • 包装和储存:
    • 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管;
    • 干粉蓝冰运输,DMSO溶液干冰运输;
    • 排布:96孔板:1st & 12th 空白对照,384孔板:1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。
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