Name: sCy5DL-amide
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HIT ID:HIT219564858
Cas No:
常用名:sCy5DL-amide
IUPAC:2-[(1E,3E)-5-[(2E)-1-(5-{[(5R)-5-azaniumyl-5-carbamoylpentyl]carbamoyl}pentyl)-3,3-dimethyl-5-sulfonato-2,3-dihydro-1H-indol-2-ylidene]penta-1,3-dien-1-yl]-1,3,3-trimethyl-3H-indol-1-ium-5-sulfonate
IUPAC:2-[(1E,3E)-5-[(2E)-1-(5-{[(5R)-5-azaniumyl-5-carbamoylpentyl]carbamoyl}pentyl)-3,3-dimethyl-5-sulfonato-2,3-dihydro-1H-indol-2-ylidene]penta-1,3-dien-1-yl]-1,3,3-trimethyl-3H-indol-1-ium-5-sulfonate
InChI key:KASKHZOOXRBMET-SSEXGKCCSA-N

分子式:C38H51N5O8S2
分子量:769.97
氢键供体数 (HBD):
氢键受体数 (HBA):
LogP:
SMILES:C[N+]1=C(\C=C\C=C\C=C2\N(CCCCCC(=O)NCCCC[C@@H]([NH3+])C(N)=O)c3ccc(cc3C2(C)C)S([O-])(=O)=O)C(C)(C)c2cc(ccc12)S([O-])(=O)=O
SMILES:C[N+]1=C(\C=C\C=C\C=C2\N(CCCCCC(=O)NCCCC[C@@H]([NH3+])C(N)=O)c3ccc(cc3C2(C)C)S([O-])(=O)=O)C(C)(C)c2cc(ccc12)S([O-])(=O)=O

sCy5DL-amide是一种荧光D-氨基酸，适用于标记多种细菌的肽聚糖，包括革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌和分枝杆菌。特别适合于革兰氏阳性的B.subtilis的标记。使用sCy5DL-amide标记的细菌可通过单分子定位显微镜技术(SMLM；也称为PALM或STORM)进行成像。激发/发射最大值为646/666 nm。

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