Endonuclease

MU1409 是一种MRE11核酸酶抑制剂，其IC50为12.1 μM。除此之外，MU1409 对FEN1和EXO1也有抑制作用，IC50分别为24.2 μM和176.4 μM。MU1409 能影响细胞内DNA修复，阻止BRCA2缺陷细胞中停滞复制叉的降解，这为BRCA2突变相关的癌症研究提供了潜力。

PFM39 是一种选择性 MRE11 核酸外切酶抑制剂，是 Mirin 类似物，可延长有丝分裂。PFM39 抑制 HR，可缓解由 EXO1/BLM 耗竭引起的修复缺陷。

MU147 是一种具有抗癌活性的 MRE11 核酸酶抑制剂和化学探针，对体内外的 Ehrlich 腹水肿瘤细胞具有致死性。MU147 消除依赖于 MRE11 核酸酶活性的双链断裂修复机制，而不影响 ATM 的激活。它还损害停滞复制 FOX 的新生链降解，并选择性影响 brca2 缺陷细胞。

AD16 (Acetamide) 是一种 LINE-1 逆转录转座子内切酶 (LINE-1 retrotransposon endonuclease) 的抑制剂，IC50 值为 4.7 μM。AD16 (Acetamide) 能减少衰老细胞中的 LINE-1 逆转录以及由其引发的 DNA 损伤和炎症。

PNR-3-80 是一种选择性 EndoG 抑制剂，其对 EndoG 的 IC50 值为 0.67 μM，优于对 DNase I 的抑制。PNR-3-80 对 DNase II、RNase A、蛋白酶、乳酸脱氢酶以及超氧化物歧化酶 1 无抑制作用。它展现出显著的细胞保护活性，能够有效保护人前列腺癌细胞不受 Cisplatin 和 Docetaxel 引发的细胞死亡影响，并抑制 Etoposide 引起的 DNA 损伤和自噬 (autophagy)。PNR-3-80 适用于细胞损伤的研究。

PFM01 是 MRE11核酸内切酶抑制剂，是 N-烷基化的 Mirin 衍生物。它可以通过非同源末端连接 (NHEJ) 和同源重组 (HR) 调节双链断裂修复 (DSBR)。

PFM03是一种特异性阻断Mre11的内切酶抑制剂，还能够降低98%的MRN内切酶活性，阻断hMRN介导的蛋白结合端5 ‘和3 ’链上的内切切口和核外溶过程。

Cyclic tri-AMP 是环状寡核苷酸抗噬菌体信号系统 (CBASS) 中的重要成分，在应对病毒感染的免疫反应中，它作为第二信使发挥作用。它与 DNA 核酸内切酶 NucC 结合并激活该酶，从而导致细胞死亡并产生抗病毒效果。

FEN1-IN-SC13 是有效的DNA 片段化核酸内切酶 1 抑制剂。